Puugihooaeg on Eestis täies hoos. Kõige tõhusam kaitse puukentsefaliidi vastu on jätkuvalt vaktsineerimine ning pärast puugihammustust tuleks keskenduda eelkõige sümptomite jälgimisele, mitte puugi uurimisele. Borrelioosi vastu veel vaktsiini ei ole, kuid arendustöö käib.